Marcus bemerkte ein Muster in der Tabelle von Problem 7, hatte aber Schwierigkeiten, genau zu erklären, was er bemerkte. Hier ist, was er zu seiner Gruppe sagte: Eine biologische Erklärung dieser Daten kann in dem Phänomen der überlappenden ORFs in bakteriellen Operonen sein. TAG ist das einzige Codon, das keine minimale Überlappung aufnimmt, während TAA eine Art Stop-Start-Codon-Überlappung (TAATG) und TGA sogar zwei Arten (ATGA und TGATG) geben kann. Vielleicht, wenn die Autoren ihre Probe auf die Beendigungcodons in den letzten (oder nur) Genen in Operonen beschränken würden, würden sie viel weniger Unterschied zwischen der Fitness dieser beiden und TAG sehen? Poole ES, Brown CM, Tate WP: Die Identität der Basis nach dem Stop-Codon bestimmt die Effizienz der in vivo translationalen Beendigung in Escherichia coli. EMBO J. 1995, 14: 151-158. Die meisten Erfahrungen mit der PISA-Methode zur Quantifizierung der Regurgitation liegen bei MR. Qualitativ sollte das Vorhandensein von PISA bei einer Routineuntersuchung (bei Nyquist-Grenze von 50–60 cm/s) auf das Vorhandensein signifikanter MR aufmerksam machen. Mehrere klinische Studien haben PISA-Messungen der regurgitanten Durchflussrate und EROA validiert [12,46,47] . Wie bereits erwähnt, gibt es viele technische Überlegungen im Zusammenhang mit der optimalen Erfassung von Strömungskonvergenzbildern und der Quantifizierung des mitralen regurgitanten Öffnungsgebiets durch PISA. Diese Methode ist für zentrale regurgitant Jets genauer als exzentrische Düsen und für eine kreisförmige Öffnung als eine nicht-kreisförmige Öffnung. Die Strömungskonvergenz sollte in der apikalen Ansicht, in der Regel der Vierkammeransicht, mithilfe eines Zoommodus optimiert werden. Das Kombinieren von Daten aus zwei Ansichten durch die Haupt- und Nebenachsen einer nicht kreisförmigen Öffnung (apikale Zwei- und Vierkammeransichten) bietet eine höhere Genauigkeit, erhöht jedoch die Komplexität [8,44,48] .
Die Größe des PISA hat nur Bedeutung in Bezug auf die Aliasing-Geschwindigkeit, die die Farboberfläche definiert. Die Ergebnisse variieren stark bei Berechnungen mit unterschiedlichen Aliasinggeschwindigkeiten, und es ist darauf zu achten, dass die Geschwindigkeit verwendet wird, mit der die hemisphärische Formel am besten anwendet [49,50] . Darüber hinaus ist es für die Bestimmung von EROA unerlässlich, dass das CW Doppler Signal gut mit dem regurgitanten Strahl ausgerichtet ist. Eine schlechte Ausrichtung auf einen exzentrischen Jet führt zu einer Unterschätzung der Geschwindigkeit und einer Überschätzung des EROA. Im Allgemeinen ist ein EROA -0,4 cm2 mit schweren MR, 0,20–0,39 cm 2 mit moderatem und 0,20 cm 2 cm mit mildem MR. Einige Fraktionen haben jedoch Dezimaldarstellungen, die für immer in einem sich wiederholenden Muster weitergehen, wie: Beispiele für Jet-Aufnahmen von Farbe Doppler, kontinuierliche Welle Doppler und Lebervenenfluss durch gepulsten Doppler in einem Fall von leichter Trikuspidal-Regurgitation (TR) und ein anderes mit schwerem TR. Der Fall des milden TR zeigt einen kleinen zentralen Farbstrahl mit minimaler Strömungskonvergenz im Gegensatz zum schweren TR mit einer sehr großen Strömungskonvergenz und Jet-Fläche im rechten Atrium. DIE CW-Doppler-Aufnahme zeigt eine parabolische Spektralanzeige in mildem TR, während bei schwerer TR frühe Spitzen- und Dreiecksform der Geschwindigkeit zu sehen ist (Pfeil). Hepatische Venenflussmuster in milden TR ist normal, während bei schweren TR, Leber venöse Flussumkehr in Systole (S) gesehen wird. D = diastolischer Lebervenenfluss.
Die Hypothese der selektiven Äquivalenz von Stop-Codons wurde nicht rigoros getestet, und entgegen der allgemeinen Erwartung gibt es Daten, die darauf hindeuten, dass Stop-Codon möglicherweise nicht ganz synonym ist. Erstens kann die Effizienz der Translationsbeendigung von Nukleotid-Kontextabhängig sein [9–13]. Zweitens sind TAG- und TGA-Stopp-Codon-Frequenzen in bakteriellen Genomen mit unterschiedlichen GC-Inhalten auffallend unterschiedlich (siehe Abbildung 1 in [14]), so dass die TGA-Frequenz mit genomischem GC-Gehalt zunimmt, während TAG GC-gehaltunabhängig ist. Hier untersuchen wir Stop-Codon-Frequenz und Evolution in bakteriellen Genomen, um ein Verständnis dafür zu gewinnen, ob Stop-Codons wahllos ohne Fitnesskosten verwendet werden oder nicht.